论文因重复高被拒后再投

这种的一般不建议再投了 有可能会被认为是学术不端行为，可以认真修改好再投其他

换吧，一般第一印象不好了就不好中了。

用iThenticate查的重，主要集中在方法部分，文章内容很符合杂志口味，认真修改后重投还有希望吗？

没必要，重复率高编辑会认定是抄袭或者剽窃，属于学术问题，不打入黑名单就算幸运了。就不要再去自投罗网了。

一般是什么时候查重啊，是送审前还是送审后啊，有审稿意见吗？

看拒稿邮件怎么说吧，有的期刊会告诉修改之后可以重投，就算没说，只要你认真改了，重新投稿是可以的。cover letter没必要说吧，一般投稿系统中有选项会问 之前是否投稿过，可以添加适当说明。

这可未必
有些期刊是投稿后系统自动查重，过了某个阈值就给主编发信息提示～主编根据查重报告、论文内容，给出继续审稿/修改再投/直接毙